《怪物猎人物语3：命运双龙》里面有很多不同的巢穴，普通巢穴分为三种稀有度等级：普通、稀有和超稀有。与之前的作品不同，巢穴的稀有度并不会影响你从中获得的蛋的种类，而只会提高获得稀有基因的概率。
稀有度等级
普通巢穴分为三种稀有度等级：普通、稀有和超稀有。与之前的作品不同，巢穴的稀有度并不会影响你从中获得的蛋的种类，而只会提高获得稀有基因的概率——因此，如果你只是在收集蛋，普通巢穴依然值得花时间去寻找。
每次加载一个区域时，都会生成新的巢穴;只要离开该区域，巢穴便会重置。无论是城镇、地下城地图，还是完全不同的其他区域，所有巢穴(不包括任务巢穴)都会被重置并生成新的巢穴。
更改时间不会重置密度(除非您仅能访问阿祖里亚地区)。
您能从巢穴中获得的蛋种类取决于巢穴所在的区域和地点;巢穴中会显示几种可能的蛋，以展示您可以获得的部分蛋，但这些蛋仅用于装饰，并不影响概率(例如，一个巢穴显示的是迅猛龙蛋，并不意味着您一定能捡到这种蛋)。
(虽然没显示，但我从这个巢里得到了一只粉红拉提安的蛋)
栖息地恢复将改变你从蛋中获取的基因质量，并影响可找到的物种类型(不过我不确定高等级怪物的蛋是否比低等级怪物的蛋更易获得)
